研究者提出了SARS-CoV-2病毒出现的两种可能情景,第一种可能是,新冠病毒源自人类SARS病毒与另外类似SARS的病毒两者间进行的重组;第二种可能则至少发生了两种不同的重组事件,其中一种导致了人类SARS病毒,另一种产生了这次的SARS-CoV-2。
来自美国哥伦比亚大学和哈佛大学的研究团队发现,新型冠病毒最早可能在2009年就通过重组,获得了SARS的遗传特征,并在此后通过融合进化成今日的新型冠病毒SARS-CoV-2。新冠病毒是一种此前未被发现的新型RNA冠状病毒,它在核苷酸水平上与SARS病毒具有80%的相似性。这项研究在预印本平台上发表。
该研究团队尝试通过对新冠病毒的基因进行分析,以确认该病毒的起源及其进化的方式。研究者发现包括SARS和MERS等人类感染病毒在内的β冠状病毒的重组常常包含Spike基因的受体结合域(Receptor Binding Domain,RBD)。进一步分析研究发现,这个共同的过程可能导致至少11年前在SARS-CoV-2的一个祖先中发生了一次重组事件,涉及RBD。与蝙蝠分离株相比,SARS-CoV-2的近期祖先在RBD和多蛋白Orf1a区域积累了大量的氨基酸替代,而Orf1a是病毒复制和转录的关键区域。在这些最近的突变中,研究者在427N和436Y位置发现了2003年SARS暴发分离株中常见的氨基酸替换,这表明了潜在的适应性趋同进化。427N和436Y都属于一个似乎与人类ACE2受体相互作用的螺旋结构。
基于以上研究,研究者提出了SARS-CoV-2病毒出现的两种可能情景,第一种可能是,新冠病毒源自人类SARS病毒与另外类似SARS的病毒两者间进行的重组;第二种可能则至少发生了两种不同的重组事件,其中一种导致了人类SARS病毒,另一种产生了这次的SARS-CoV-2。该研究团队甚至推断也有可能早在2003年SARS暴发时就已经发生重组,从那时起冠状病毒就已经获得了感染人类宿主的能力。(编译:李伟)
参考文献:bioRxiv preprint doi:https://doi.org/10.1101/2020. 02.10.942748