约有31%~69%的COVID-19患者患有急性后遗症（post-acute sequelae of COVID-19, PASC），或称为长期COVID（long COVID），指首次感染后四周或更长时间内有新发、复发或持续的健康问题。从COVID-19中恢复可能需要很长时间。一项发表于《细胞》杂志的研究中，美国弗雷德•哈钦森癌症研究中心的Su等对209名临床诊断时（T1）、急性发病期（T2）和发病后2~3个月（T3）的COVID-19患者（71%住院率）进行了多组学分析。

在T3期，44%的患者对所检测的6种自身抗体（IFN-α2和核蛋白）呈阳性，其中一半在T1期呈阳性（亚临床水平为94%）。T3期患者自身抗体与T2期炎症生物标记物相关，与SARS-CoV-2 IgG滴度呈负相关。T3期的呼吸道症状与IFN-α2自身抗体相关；神经症状与SARS-CoV-2 IgG滴度相关；疲劳与T1期时Epstein-Barr病毒再激活相关；胃肠道症状与伴有巨细胞病毒特异性CD8+T细胞旁观者激活相关。

单细胞RNA测序将患者分为四组：1型，T细胞、单核细胞和NK细胞中富含TH1、M1和细胞毒性特征，B细胞中富含记忆特征；2型，富含TH2、M2和血浆B细胞特征；中间型（介于1型和2型之间）；幼稚T细胞和NK细胞，4种类型都具有高单核细胞多功能性。T1时的转录组学特征可以预测T3期的类型，这表明患者在感染早期可能倾向于急性后状态。

参考文献：Yapeng SU Ya-peng, YUAN Dan, Chen DG, et al. Multiple early factors anticipate post-acute COVID-19 sequelae[J]. Cell,2022,185:881-895.