癌症是由一系列不同的体细胞和生殖细胞基因突变造成的。基因测序技术的进步让检测基因突变具有更高的敏感性。然而,将这些手段以个性化的方式整合到临床管理中具有很大的挑战性。
为了评价使用综合临床测序和遗传咨询对儿童和年轻癌症患者的评估和治疗的影响,美国霍华德•休斯医学研究所的Arul M. Chinnaiyan博士等研究人员设计了一项单中心观察性连续病历系列(2012年5月至2014年10月)研究,纳入102例患有复发性、难治性或罕见肿瘤的儿童或年轻患者(22岁以下,平均年龄10.6岁)102例。
患者接受综合的临床外显子组(肿瘤和生殖细胞DNA)和转录组(肿瘤RNA)测序以及遗传咨询。肿瘤精准医学专家团讨论后向患者家属和医生作出推荐。主要结果和测量指标为:发现潜在可操作的基因突变的患者比例,根据综合临床测序结果采取临床干预措施的效果,以及未来有肿瘤风险的患者或其家属比例。
最终完成肿瘤组织测序的91例患者中,28例为血液系统恶性肿瘤,63例为实体瘤。42例(46%)患者发现了可以通过治疗处理的基因变异,其中15例为血液系统恶性肿瘤患者,27例的实体瘤患者。23例患者根据综合临床测序结果作出了个人的实际行动,其中14例改变了治疗方案,9例对未来的肿瘤风险进行了遗传咨询。9例患者在个体化的临床干预后,实现了8~16个月的部分临床缓解,或在帮助下维持了6~21个月的完全临床缓解。这9例患者的家属和患者本人同意遗传咨询和基因筛查结果。
该研究显示,把综合临床测序数据与临床治疗结合起来是可行的,46%的患者在基因筛查后都发现了潜在的可以临床处理的基因突变,而且一小部分患者及其家属还听从了专业建议,改变了治疗方案,接受了家庭遗传咨询。然而,因为研究未设立对照组,无法说明在肿瘤治疗中安排综合临床测序一定比标准疗法带来的临床结局更好,希望未来有进一步的研究跟进。(作者:仇正虹)
参考文献:Journal of the American Medical Association 2015;314:913-925