目前,人们对血浆中游离DNA作为诊断标志物越来越感兴趣,尤其是在肿瘤患者的血浆中已经检测到了肿瘤相关DNA,在孕妇的血浆中发现了胎儿来源的DNA。对血浆中这些DNA的发现在肿瘤检测以及非侵入性产前检查中具有重要意义。
香港中文大学李嘉诚健康研究所的研究人员使用鸟枪法和亚硫酸氢盐测序法对全基因组甲基化进行检测,以此作为癌症的标志物。同样,也可以从亚硫酸氢盐DNA
测序数据中观察到肿瘤相关的拷贝数畸变(copy number aberrations,
CNAs)。在患有肝癌、乳腺癌、肺癌、鼻咽癌、平滑肌瘤和神经内分泌肿瘤的病人中,血浆DNA检测到了低甲基化和CNAs。血浆低甲基化用于检测非转移
性癌症病例,其敏感性和特异性分别为74%和94%。
这一特点表明,基于低甲基化分析方法可能是癌症检测的好方法。这项研究还证明,低甲基化检测对于监测肝癌患者肿瘤切除后以及检测残留病灶有很大帮助。
血浆低甲基化可以与血浆CNAs分析联合起来,来增强检测的灵敏度和特异性。使用至少一种类型的检测来定义异常时,可以使灵敏度达到87%、特异性达到88%。
这项研究扩大了血浆DNA分析在癌症检测和监控中的应用。(作者:贺利军)
参考文献:《Proceedings of the National Academy of Sciences》2013;110:18761-18768